系统发生足迹技术在巴西固氮螺菌基因组特征搜(2)
2014-11-16 01:00
导读:表1: 基因分组 并行性分析:蛋白质分组需要将所有的蛋白质相似度信息进行比较,因此本模块不能并行执行,必须由一台计算机独立完成。 2.1.4 寻找mot

表1: 基因分组 并行性分析:蛋白质分组需要将所有的蛋白质相似度信息进行比较,因此本模块不能并行执行,必须由一台计算机独立完成。 2.1.4 寻找motif 系统发生足迹是在与p90相关的基因间序列中寻找motif,得到了基因分组后,根据基因名称将调控其编码的基因间序列提取出来。 以同组的基因间序列作为输入,使用MotifSampler软件来寻找侯选motif, 该软件采用Gibbs采样算法,Gibbs通过随机采样不断更新motif 模型和在各条序列中的出现位置以优化目标函数,当满足一定的迭代终止条件时就得到了最终的候选motif。[4] 共2页: 1 [2] 下一页 论文出处(作者):
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