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关于细菌分类学研究(2)

2017-09-09 03:42
　　16S rRNA特异引物的设计是建立在大量序列分析基础之上的。若能设计出一系列特异引物，如属特异引物，则菌种筛选过程将大为简化。种特异的引物主要用于鉴定，结合属特异引物联合应用则可能发现新种。
　　
　　3. 细菌分类学发展的研究趋势
　　
　　今后细菌分类学的发展将集中于以下几个方面：
　　(1) 分析方法的标准化
　　有研究表明，细菌的脂肪酸、磷脂与醌类组成及含量随着培养条件的变化而不同[71]。所以化学分类必须建立标准化的方法，这样定量才有意义，更准确，更具可比性。
　　(2) 多相分类方法的广泛应用及分子分类法的发展
　　由于各种分子生物学技术方法在分类学中的应用，细菌分类学家的研究重点已不仅是对某个分类单元的分类鉴定，而是通过分子分类的方法把分类与进化紧密的结合起来。在未来几年内16S rDNA/rRNA作为重要的系统发育分子仍将发挥主导作用，但是其它保守分子将更多的用于系统发育研究，如RNA聚合酶P, HSP60基因，延伸因子Tu, 23S rDNA/rRNA, rDNA转录间隔区等。
　　(3) “在线分类”的发展
　　现代细菌分类研究越来越依赖于Internet，我们不仅需要大量的分子生物学和系统发育分析软件，更离不开网上丰富的信息资源。因此，Oren和Stackebrandt于2002年提出了原核生物“在线分类”(online taxonomy)的概念[6]。
　　(4) 分类学研究与细菌资源研究结合
　　很多科研单位己注意到将系统分类与细菌资源的开发研究相结合，例如日本的北理研究所、理化研研究所、明治制药等。
　　
　　参考文献
　　[1] 宋延龄, 杨亲二, 黄永青. 物种多样性研究与保护[M]. 浙江科学技术出版社, 1998.
　　[2] Burkholder PR, Pfister MR, Leitz HF. Production of a pyrrole antibiotic by a Marine baeterium. Applied Mierobial, 1966, 14: 649-653.
　　[3] Kersters,K.,Pot,B.,Dewettinck,D., et al. Indentification and typing of bacteria by protein eletrophoresis. In： Priest P G,Ramos-Cormenzana A,and Tyndall B ed. Bacterial diversity and systematics. New York： Plenum Press, 1994.
　　[4] 张建丽, 刘志恒. 链霉菌的rep-PCR基因指纹分析.微生物学报, 2004,44(4): 281-285.
　　[5] De Smedt, J., De Ley,J. Intra-and intergeneric similarities of Agrobacterium ribosomal ribonucleic acid cistrons.Int J Syst Bacteriol, 1977, 27: 222-240.
　　[6] Oren, A. and Stackebrandt, E. Prokaryote taxonomy online: challenges ahead. Nature, 2002,419: 15.