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鼻息肉和鼻息肉病的差异蛋白质组学分析

2015-04-03 02:35
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毕业

全部作者: 贺广湘 孙虹 王天生 李萃
第1作者单位: 中南大学湘雅3医院耳鼻咽喉科
摘要: 目的 建立鼻息肉及鼻息肉病双向凝胶电泳(two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis, 2-DE)图谱,筛选鉴定差异表达蛋白质。方法 收集鼻息肉及鼻息肉病样本各7例,固相pH梯度2-DE、凝胶银染,扫描图像, ImageMaster 2-DE Elite 4.01软件分析,识别差异表达蛋白质,质谱仪得到相应肽质指纹图谱(peptide mass fingerprint, PMF),PeptIdent软件查询Swiss-Prot and TreMBL数据库,鉴定差异表达蛋白质。结果:(1). 鼻息肉及鼻息肉病各自随机挑选的1个样本3次重复2-DE,平均蛋白质点数分别为825±78和891±67;匹配点数为682±96个和767±83,平均匹配百分率为82.7%和86.1% ;同1鼻息肉病的3块胶在蛋白质点位置上有较好的重复性,不同胶间蛋白质点在等电聚焦(IEF)方向偏差为1.13±0.16mm,在SDS-PAGE方向偏差为1.45±0.21mm。分析两种组织各7例样本的2-DE图谱的平均凝胶图谱,鼻息肉与鼻息肉病蛋白质点数为1458和1532,匹配点数为1201个。(2). 质谱分析差异蛋白质点20个,查询数据库鉴定出差异蛋白质10个。结论 本研究建立了分辨率高和重复性好的鼻息肉和鼻息肉病的2-DE图谱,识别鉴定出1些与病变相关的差异表达蛋白质。
关键词: 鼻息肉;鼻息肉病;鼻粘膜;蛋白质组学;差异蛋白质 远程下载 (免费PDF全文)
发表日期: 2006年11月30日
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