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全部作者: 蒋黎丽 Lu Yinghua 第1作者单位: 北京邮电大学 摘要: 大量的基因表达数据的信号传导通路的分析与解释是1项具有挑战性的任务。其中,聚类技术是得到数据的内在模型的较有效和流行的1种方法之1。为了找到建立基于头颈部鳞癌基因表达的p38 MAPK理论信号传导通路的最好方法,我们运用皮尔逊相关,欧氏距离,欧式距离谐函数,斯皮尔曼等级相关,肯德尔T,城区距离等普通的分层聚类算法并进行比较。运算法则构造了1个基于自组织树的自上而下的层次。它有力的找到每层的簇的数量。我们发现皮尔逊相关,肯德尔T,城区距离,欧氏距离都适合用来分析头颈部鳞癌的基因表达谱中从MAP3K11(MLK3),MAP2K3(MKK3), MAPK11(P38 MAPK/β) 到MEF2A的串联组合。结果和生物实验得出的p38 MAPK信号传导通路是1致的。 关键词: 基因表达,聚类,信号传导通路,头颈部鳞癌 (浏览全文) 发表日期: 2007年09月14日 同行评议:
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